Biostatistique en grande dimension

Biostatistique en grande dimension

Biostatistique en grande dimension pour la sécurité des médicaments et la génomique (HiDiBiostat)

L'équipe s’intéresse aux questions statistiques émergeant en santé publique et en recherche clinique avec l'essor de l’accès aux données de grande dimension et de leur utilisation. L'évaluation des effets indésirables des médicaments et la génomique prédictive sont nos deux principaux axes de développement méthodologique. Ils impliquent tous deux des questions de grande dimension et font appel notamment à des approches d'apprentissage statistique.

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Notre premier axe est consacré à l’évaluation des médicaments en population avec des développements méthodologiques en pharmacoépidémiologie et en pharmacovigilance.

Nous avons un intérêt particulier pour les vaccins et les médicaments pris pendant la grossesse. Nos orientations récentes impliquent également l’exploitation des bases de données médico-administratives telles que le système national des données de santé (SNDS) en France. En pharmacoépidémiologie, nous avons pour objectif de développer des méthodes statistiques pour l’exploitation des données du SNDS prenant en compte la confusion mesurée ou non. Par ailleurs nous travaillons sur des méthodes d’estimation d’impact en santé publique : le rapport bénéfice-risque des vaccins et le risque attribuable. En pharmacovigilance, nous développons des méthodes de détection automatique de signaux visant à exploiter les grandes bases de données de notifications spontanées et plus récemment du SNDS. Ces méthodes s’appuient sur les champs statistiques de la sélection de variables et de la causalité en grande dimension.

 

Notre deuxième axe porté par le groupe Genostat est consacré à la génomique prédictive et à la génétique épidémiologique. Les objectifs sont entre autres : (i) le développement de stratégies intégratives qui utilisent diverses sources d'informations "internes" (par exemple des échantillons cliniques) ou "externes" (par exemple des bases de données) et en particulier des informations internes multicouches provenant de la génomique, de la transcriptomique et de la protéomique pour la prédiction ; (ii) le développement de méthodes relatives aux tests d’association avec des variants rares, notamment pour les données de séquençage de l’exome.

Site

Hôpital Paul Brousse, Bat. 15/16

16 av, Paul Vaillant Couturier
94807 Villejuif


Members

Ismail
AHMED
Researcher
Biostatisticien.ne
Lucas
ANZELIN
Associated researcher
Biostatisticien.ne
Jacques
BENICHOU
Researcher
Biostatisticien.ne
Philippe
BROET
Researcher
Co-head
Emeline
COURTOIS
Researcher
Biostatisticien.ne
Romain
DEMAILLY
Associated researcher
Chi-Hong
DUONG
Ph Student
Biostatisticien.ne
Sylvie
ESCOLANO
Engineer and technician
Biostatisticien.ne
Sidonie
FOULON
Ph Student
Biostatisticien.ne
Florence
GHESTEM
Ph Student
Biostatisticien.ne
Matthieu
HANF
Associated researcher
Biostatisticien.ne
Iuliana
LAZA
Chercheur associé
Statisticien.ne
Anne-Louise
LEUTENEGGER
Associated researcher
Biostatisticien.ne
Lucas
MORIN
Researcher
Epidemiologist
Astelle
NDIAYE
Ph Student
Epidemiologist
Hervé
PERDRY
Researcher
Biostatisticien.ne
Matthieu
PLUNTZ
Researcher
Biostatisticien.ne
Catherine
QUANTIN
Researcher
Epidemiologist
Elise
QUENTIN
Engineer and technician
Biostatisticien.ne
Yanis
SAIDI
Engineer and technician
Biostatisticien.ne
Marc - Antoine
SANCHEZ
Ph Student
Physician
Anne
THIÉBAUT
Researcher
Biostatisticien.ne
Jean-JosuÉ
TOKPO
Ph Student
Epidemiologist
Pascale
TUBERT-BITTER
Researcher
Head
Ana-Maria
VILCU
Researcher
Biostatisticien.ne
Etienne
VOLATIER
Researcher
Statisticien.ne

Last publications

A Simple Information Criterion for Variable Selection in High-Dimensional Regression. Pluntz, Matthieu; Dalmasso, Cyril; Tubert-Bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl. Statistics in Medicine. 2025; 44: p.e10275. doi:10.1002/sim.10275
Article
Application of three statistical approaches to explore effects of dietary intake of multiple persistent organic pollutants on ER-positive breast cancer risk in the French E3N cohort. Frenoy, Pauline; Ahmed, Ismaïl; Marques, Chloé; Ren, Xuan; Severi, Gianluca; Perduca, Vittorio; Mancini, Francesca Romana. Scientific Reports. 2025; 15: p.2058. doi:10.1038/s41598-025-85438-9
Article
Vaginal microbiota stability over 18 months in young student women in France. Tamarelle, Jeanne; Thiébaut, Anne C. M.; de Barbeyrac, Bertille; Bébéar, Cécile; Bourret, Antoine; Fauconnier, Arnaud; Ravel, Jacques; Delarocque-Astagneau, Elisabeth; i-Predict study group. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases: Official Publication of the European Society of Clinical Microbiology. 2024; 43: p.2277-2292. doi:10.1007/s10096-024-04943-3
Article
The prevalence of polypharmacy in older Europeans: A multi-national database study of general practitioner prescribing. Bennie, Marion; Santa-Ana-Tellez, Yared; Galistiani, Githa Fungie; Trehony, Julien; Despres, Johanna; Jouaville, Laurence Sophie; Poluzzi, Elisabetta; Morin, Lucas; Schubert, Ingrid; MacBride-Stewart, Seán; Elseviers, Monique; Nasuti, Paola; Taxis, Katja. British Journal of Clinical Pharmacology. 2024; 90: p.2124-2136. doi:10.1111/bcp.16113
Article
Impact of COVID-19 pandemic on characteristics, extent and trends in child maltreatment in 34 Euro-CAN COST Action countries: a scoping review protocol. Cankardas, Sinem; Tagiyeva-Milne, Nara; Loiseau, Mélanie; Naughton, Aideen; Grylli, Chryssa; Sammut-Scerri, Clarissa; Pivoriene, Jolanta; Schöggl, Johanna; Pantazidou, Anastasia; Quantin, Catherine; Mora-Theuer, Eva Anna. BMJ open. 2024; 14: p.e080183. doi:10.1136/bmjopen-2023-080183
Article

Theses defended

Sélection de variables et inférence statistique en grande dimension avec les régressions pénalisées : application aux données de notifications spontanées en pharmacovigilance. Pluntz, Matthieu; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl; Dalmasso, Cyril. []: université Paris-Saclay; 2024.
Thesis
Approches statistiques causales en grande dimension pour la détection de signaux en pharmacovigilance : application aux notifications spontanées et aux données médico-administratives. Volatier, Etienne; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl. []: université Paris-Saclay; 2024.
Thesis
Approches statistiques en pharmacoépidémiologie pour la prise en compte de facteurs de confusion indirectement mesurés dans les bases médico-administratives. Duong, Chi hong; Tubert-bitter, Pascale; Ahmed, Ismaïl. []: université Paris-Saclay; 2024.
Thesis
Développements méthodologiques pour l'étude du rôle des variants récessifs rares dans les maladies multifactorielles. Foulon, Sidonie; Perdry, Hervé; Leutenegger, Anne-Louise; Truong, Thérèse. []: université Paris-Saclay; 2022.
Thesis
Modélisation de l'impact d'une exposition médicamenteuse dans le temps : estimation de la fonction de risque et de la fraction de risque attribuable. Manitchoko, Liliane; Thiebaut, Anne; Benichou, Jacques. []: université Paris-Saclay; 2022.
Thesis
Abord de l'épidémiologie des cancers par des données de registre et des données médico-administratives : complémentarité des deux approches.. Simon, Julien; Quantin, Catherine. []: université Paris-Saclay; 2022.
Thesis
Critères d'évaluation de la validité des estimateurs d'intervalle de confiance. Gillibert, André; Benichou, Jacques; Falissard, Bruno. []: université Paris-Saclay; 2021.
Thesis
Modélisation dynamique des infections et co-infections génitales à papillomavirus humain (HPV) et de l’impact à long terme de la vaccination anti-HPV. Bonneault, Mélanie; Thiebaut, Anne; Opatowski, Lulla. []: université Paris-Saclay; 2021.
Thesis
Mesures d’impact de nouveaux parcours patient sur la qualité des soins. Sanchez, Marc-Antoine; Quantin, Catherine. []: ; 2021.
Thesis
Détection automatisée de signaux en pharmacovigilance chez la femme enceinte à partir de bases médico-administratives Prescription drug use during pregnancy in France: a study from the national health insurance permanent sample Identifying drugs inducing prematurity by mining claims data with high-dimensional confounder score strategies. Demailly, Romain; Tubert-Bitter, Pascale. []: université Paris-Saclay; 2020.
Thesis
Score de propension en grande dimension et régression pénalisée pour la détection automatisée de signaux en pharmacovigilance Propensity Score-Based Approaches in High Dimension for Pharmacovigilance Signal Detection: an Empirical Comparison on the French Spontaneous Reporting Database New adaptive lasso approaches for variable selection in automated pharmacovigilance signal detection. Courtois, Émeline; Tubert-Bitter, Pascale. []: université Paris-Saclay; 2020.
Thesis
Étude de la composante génétique de la variabilité des infections palustres simples : Approche génome entier dans deux cohortes de jeunes enfants au Bénin First Genome-Wide Association Study of Non-Severe Malaria in Two Birth Cohorts in Benin Mixed logistic regression in Genome-Wide Association Studies. Milet, Jacqueline; Perdry, Hervé. []: université Paris-Saclay; 2020.
Thesis
Studying the genetic architecture of complex traits in a population isolate. Herzig, Anthony Francis; Leutenegger, Anne-Louise B.. []: Sorbonne Paris Cité; 2019.
Thesis
Modélisation de phénotypes complexes longitudinaux à l'aide de réseaux pour identifier les variants génétiques impliqués dans ces phénotypes. Lambert, Judith; Jannot, Anne-sophie; Baudot, Anais. []: Université Paris Cité; 2019.
Thesis
Prédiction du parcours de soins et du développement des enfants vulnérables. Anzelin, Lucas; Thiebaut, Anne; Hanf, Matthieu. []: université Paris-Saclay; 2019.
Thesis
Identification de nouveaux gènes impliqués dans la survenue d'hémorragies intracrâniennes fœtales. Coste, Thibault; Tournier-lasserve, Elisabeth. []: Université Paris Cité; .
Thesis